بعد از بازگشت تیم ملی از منامه، پاسخ شهاب‌الدین عزیزی خادم به خبرنگاران درباره ادامه همکاری با اسکوچیچ موجب شائبه‌هایی در مورد ادامه حضور دراگان در رأس کادر فنی تیم ملی شد. جایی که رئیس فدراسیون فوتبال در پاسخ به سؤال خبرنگاری مبنی بر ادامه حضور یا عدم ادامه حضور اسکوچیچ در تیم ملی گفت که اعضای هیأت رئیسه باید در این باره تصمیم‌گیری کنند. این در حالی است که خبرنگاران انتظار داشتند رئیس فدراسیون فوتبال با توجه به نتایج قابل توجه تیم ملی در منامه بگوید که با اسکوچیچ همکاری خواهیم کرد. البته رئیس فدراسیون فوتبال منظور خود را بد تفهیم کرد و همینطور که در عمل نشان داد به دنبال گزینه دیگری برای تیم ملی نبود و اخبار در خصوص حضور علی دایی، برانکو، کارلوس کی‌روش و... در تیم ملی شایعه بود. به نظر می‌رسد عزیزی خادم می‌خواست این گونه تفهیم کند که اعضای هیأت رئیسه فدراسیون فوتبال هم در سرنوشت تیم ملی دخیل هستند.
در دوره قبل محول کردن همه اختیارات اعضای هیأت رئیسه به رئیس فدراسیون فوتبال موجب قرارداد مارک ویلموتس شد که هنوز فدراسیون فوتبال از این پرونده رهایی پیدا نکرده است. عملکرد خوب اسکوچیچ در تیم ملی و هفت برد در بازی‌های دوستانه و رسمی موجب شد تا اعضای هیأت رئیسه فدراسیون فوتبال با شهاب‌الدین عزیزی خادم هم‌نظر نشان بدهند و ادامه حضور اسکوچیچ در تیم ملی نهایی شود. البته بر اساس توافقی که از قبل تنظیم شده بود قرارداد مربی کروات به صورت اتوماتیک‌وار تمدید شده است و در صورتی که دراگان تیم ملی را به جام جهانی 2022 برساند، در این مسابقات هم روی نیمکت تیم ملی خواهد نشست. با این حال در این برهه از زمان، فدراسیون فوتبال می‌توانست با پرداخت پنج ماه حقوق، قرارداد اسکوچیچ را فسخ کند که در نهایت و با توجه به کارنامه‌ این مربی در منامه تصمیم گرفت به قرارداد خود پایبند باشد.
 شهاب‌الدین عزیزی خادم، رئیس فدراسیون فوتبال ایران از توافق مشترک با دراگان اسکوچیچ، سرمربی تیم ملی فوتبال ایران برای ادامه همکاری و حضور قدرتمند در ادامه راه مسابقات مقدماتی جام جهانی خبر داد. عزیزی خادم به سایت فدراسیون فوتبال گفت: «فدراسیون فوتبال با سرمربی تیم ملی تا پایان مرحله دوم مقدماتی جام جهانی به توافق مشترک رسید. قرار شد بعد از قرعه‌کشی مرحله دوم، برنامه‌ریزی مناسبی برای این مرحله صورت بگیرد و فدراسیون فوتبال همه امکانات لازم برای آماده‌سازی تیم ملی و حضور پرقدرت در مرحله دوم را در دستور کار قرار خواهد داد.»
مراسم قرعه‌کشی مرحله نهایی انتخابی جام جهانی ۲۰۲۲ قطر روز دهم تیرماه در کوالالامپور مالزی برگزار می‌شود و تیم ملی فوتبال ایران یکی از ۱۲ تیم حاضر در این مرحله است. تیم ملی در بازی‌های دوستانه بوسنی، ازبکستان و سوریه را شکست داد و در منامه بر هنگ‌کنگ، کامبوج، بحرین و عراق غلبه کرد و شاهکار تیم ملی پیروزی سه بر صفر برابر بحرین در منامه بود که در نهایت موجب صعود ایران و بازماندن میزبان گروه c بازی‌ها از صعود به دور بعدی مسابقات شد. مسابقاتی که با حضور 12 تیم در دو گروه شش تیمی برگزار می‌شود و در نهایت تیم‌های اول و دوم به طور مستقیم به جام جهانی صعود می‌کنند.
بر این اساس و با نظر مثبت اعضای هیأت رئیسه فدراسیون فوتبال و تأیید ادامه حضور اسکوچیچ در تیم ملی در ادامه مسیر، مربی کروات تیم ملی یکشنبه به زادگاهش برگشت تا با استراحت کوتاهی به تهران برگردد و مجدداً برای هدایت تیم ملی در ادامه مسیر آماده شود. با توجه به ادامه همکاری اسکوچیچ، باید ببینیم کادرفنی او هم در این راه مربی کروات را همراهی خواهند کرد یا نه؟ به خصوص کریم باقری که شاید برنامه‌های تیم ملی با باشگاه پرسپولیس تداخل داشته باشد.